Stage - Stage 4 mois - Chémoinformatique H/F

Description de l'offre : Notre laboratoire dispose d’une base de données correspondant à 17 campagnes de tests menées au CEA et chez notre partenaire sur différents agents toxiques, leurs simulants et interférents. Le nombre total de tests dépasse les 200 000 occurrences. Ces campagnes de tests ont fait intervenir des multiples formats de mise en œuvre (liquide, spotté) et tailles (1632, 192, 96, 12 molécules) de notre chimiothèque. Les analytes testés sont aussi nombreux et sous formes différentes (liquide, gaz). Les données sont déjà très structurées mais une quinzaine de paramètres différents sont nécessaires pour décrire les conditions expérimentales. Le principal résultat de chaque expérience est le virage chromogénique, c’est-à-dire le changement de couleur (sous forme primaire, des données RGB initial => RGB exposé). À partir d’une première restructuration de la base de donnée (qui pourra être poursuivie), le premier objectif du stage sera de réaliser une nouvelle exploration de cette base afin de détecter de nouveaux couples (état initial / état exposé à un analyte) qui maximisent la dissimilarité (de couleur) sous contraintes (notamment d’intensité lumineuse). Les parcours de la base déjà réalisés ont été fait sur la base d’une distance entre coordonnées de couleur (ΔE), mais d’autres systèmes de coordonnées, à définir, devraient permettre de faire ressortir d’autres singularités chromogéniques. Un second objectif du stage sera de développer une interface d'interrogation flexible (de type Parser) de façon à rendre ce criblage plus simple et plus systématique.

Profil du candidat : De formation Master 1 ou 2, de formation école ingénieur en seconde année, vous recherchez un stage de 4 mois.  Compétences scientifiques : Programmation, Big Data & Data science, Chimie organique et/ou analytique Connaissances : Extraction, transformation & chargement de données, Big Data Processing, Frameworks, Visualisation des données, … Vous êtes reconnu(e) pour votre : rigueur, bonne capacité de discernement, capacité à rendre compte, sens de la discrétion/confidentialité,

Diplome préparé : Bac+4 - Master 1

Langues : Anglais Courant