Stage en traitement d'images, électronique et systèmes optoélectroniques H/F

Description de l'offre : Les organoïdes dérivés de patients (PDO, Patient Derived Organoids) sont des cultures cellulaires 3D qui s’auto-organisent pour répliquer la structure et la fonction des organes dont ils sont issus, et qui proviennent de biopsies réalisées sur des patients. Ce sont des modèles in-vitro très prometteurs dans les domaines de la médecine personnalisée, du développement de médicaments et de la recherche biomédicale. Par exemple, plusieurs études cliniques sont en cours en France et en Europe pour utiliser ces PDO afin d’orienter le traitement des cancers en observant la réponse des cellules du patient à différents protocoles. Les équipes du CEA les emploient à des fins de recherche, et travaillent activement sur les technologies de culture et de suivi nécessaires à leur déploiement dans le parcours de soins. La microscopie est la méthode de prédilection pour observer l’évolution des PDO, et le suivi doit être réalisé sur une population afin d’obtenir des résultats statistiquement significatifs. C’est dans ce contexte qu’un stage est proposé pour développer un outil permettant de classifier rapidement une collection d’organoïdes à partir de leur morphologie. Vous utiliserez un microscope à contraste de phase différentiel mis au point au laboratoire pour faciliter l’observation d’échantillons épais. Vous serez en charge de l’acquisition d’une base de données d’images et serez encadré(e) par des biologistes pour l’annotation des morphologies d’intérêt. Vous utiliserez ces données afin d’entrainer un algorithme d’intelligence artificielle à classifier les morphologies. Votre objectif sera d’optimiser systématiquement les conditions de prise d’image et l’algorithme pour arriver à un outil validé et mis à disposition de l’équipe de biologie.

Présentation de l’institut : Le L4IV du CEA Leti adresse des problématiques en biologie et en santé en s'appuyant sur des techniques optiques d'imagerie et de spectroscopie. Dans le domaine de l'imagerie l'équipe a conçu des systèmes d'holographie digitale 2D et 3D, et se spécialise dans l'analyse des images acquises en utilisant l'Intelligence Artificielle (IA). Le laboratoire a aussi conçu un microscope optimisé pour l'observation d'échantillons épais comme les PDO, en employant la technique du contraste de phase différentiel (DPC, Differential Phase Contrast). C'est cet instrument que l'étudiant(e) mettra en œuvre pendant son stage.

Profil du candidat : Ce stage s'adresse à un(e) étudiant(e) avec une formation de niveau Master 2 en traitement d’images, électronique ou équivalent, et une solide connaissance des systèmes optoélectroniques. Une expérience pratique de l’analyse d’image par IA et de l’expérimentation avec un microscope sont recommandés. Enfin un attrait pour les applications en biologie-santé est attendu. Vous vous reconnaissez ? Rejoignez-nous, venez développer vos compétences et en acquérir de nouvelles !  Vous avez encore un doute ? Nous vous proposons : L'opportunité de travailler au sein d'une organisation de renommée mondiale dans le domaine de la recherche scientifique, Un environnement unique dédié à des projets ambitieux au profit des grands enjeux sociétaux actuels, Une expérience à la pointe de l’innovation, comportant un fort potentiel de développement industriel, Des moyens expérimentaux exceptionnels et un encadrement de qualité, De réelles opportunités de carrière à l’issue de votre stage Un poste au cœur de la métropole grenobloise, facilement accessible via la mobilité douce favorisée par le CEA, Une participation aux transports en commun à hauteur de 85%, Un équilibre vie privée – vie professionnelle reconnu, Un restaurant d'entreprise, Une politique diversité et inclusion, Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l’inclusion des travailleurs handicapés.

Diplome préparé : Bac+5 - Diplôme École d'ingénieurs