Internship on image processing, electronics and optoelectronic systems

Job description: Patient Derived Organoids (PDO) are 3D cell cultures that self-organize to replicate the structure and function of the organs from which they originate, and are derived from patient biopsies. They are highly promising in-vitro models for personalized medicine, drug development and biomedical research. For example, several clinical studies are underway in France and Europe to use these PDOs to guide cancer therapy by observing the response of patient cells to different protocols. CEA teams are using them for research purposes, and are actively working on the culture and monitoring technologies needed to deploy them in the heathcare system. Microscopy is the preferred method for observing the evolution of PDOs, and monitoring must be performed on a population in order to obtain statistically significant results. It is in this context that an internship is proposed to develop a tool for rapidly classifying a collection of organoids based on their morphology. The student will use a differential phase contrast microscope specifically developed in the laboratory to facilitate the observation of thick samples. He/She will be in charge of acquiring an image database and will be supervised by biologists for the annotation of morphologies of interest. He/She will use this data to train an artificial intelligence algorithm for classifying morphologies. His/Her aim will be to systematically optimize the image acquisitions conditions and the classification algorithm to obtain a validated tool that will be made available to the biology team.

Institute description: CEA Leti's L4IV addresses topics in biology and healthcare using optical imaging and spectroscopy techniques. In the field of imaging L4IV has developed 2D and 3D digital holography systems, and specializes in the analysis of the resulting images using AI. The laboratory has also set up a Differential Phase Contrast microscope optimized for the observation of thick samples such as PDOs. The student will employ this instrument in his work.

Your profile: Ce stage s'adresse à un(e) étudiant(e) avec une formation de niveau Master 2 en traitement d’images, électronique ou équivalent, et une solide connaissance des systèmes optoélectroniques. Une expérience pratique de l’analyse d’image par IA et de l’expérimentation avec un microscope sont recommandés. Enfin un attrait pour les applications en biologie-santé est attendu. Vous vous reconnaissez ? Rejoignez-nous, venez développer vos compétences et en acquérir de nouvelles !  Vous avez encore un doute ? Nous vous proposons : L'opportunité de travailler au sein d'une organisation de renommée mondiale dans le domaine de la recherche scientifique, Un environnement unique dédié à des projets ambitieux au profit des grands enjeux sociétaux actuels, Une expérience à la pointe de l’innovation, comportant un fort potentiel de développement industriel, Des moyens expérimentaux exceptionnels et un encadrement de qualité, De réelles opportunités de carrière à l’issue de votre stage Un poste au cœur de la métropole grenobloise, facilement accessible via la mobilité douce favorisée par le CEA, Une participation aux transports en commun à hauteur de 85%, Un équilibre vie privée – vie professionnelle reconnu, Un restaurant d'entreprise, Une politique diversité et inclusion, Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l’inclusion des travailleurs handicapés.

Level of qualification studied: Bac+5 - Diplôme École d'ingénieurs